Dalam menjalankan perannya, PUSTAFMA-714 mengedepankan pendekatan kolaboratif dengan melibatkan akademisi, peneliti, pemerintah, pelaku usaha perikanan, serta masyarakat pesisir. Sinergi lintas sektor ini menjadi fondasi utama dalam mendorong pengelolaan perikanan yang adaptif, inklusif, dan berorientasi pada keberlanjutan jangka panjang.